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南京信帆生物:靶向性蛋白質(zhì)檢測法并且證實(shí)其可行性
更新時間:2016-06-13   點(diǎn)擊次數(shù):1290次

 一個研究團(tuán)隊(duì)新研發(fā)一種可以檢測大量蛋白質(zhì)的方法,并且證實(shí)了其可行性。這種靶向性蛋白質(zhì)檢測方法具有具有系統(tǒng)地、可靠地檢測人類蛋白質(zhì)組的潛力。

新方法證實(shí)

采用自身開發(fā)的這項(xiàng)技術(shù),Paulovich和同事們可同時及準(zhǔn)確地檢測許多不同樣本中成百上千種蛋白質(zhì)的豐度。來自西雅圖、波士頓和韓國不同研究小組的研究人員,重現(xiàn)了人類ruxian癌細(xì)胞中319種蛋白質(zhì)的檢測結(jié)果,證實(shí)這種方法可跨越實(shí)驗(yàn)室和國界實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化。

Paulovich說:“這種方法有潛力*改變我們檢測人類蛋白質(zhì)的方式。利用資源對所有人類蛋白質(zhì)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化定量設(shè)立一些新標(biāo)準(zhǔn),無疑將能提高研究的可重現(xiàn)性,其將對轉(zhuǎn)化新型治療和診斷帶來巨大的影響。”

蛋白質(zhì)功能及檢測方法缺點(diǎn)

作為所有生物功能的執(zhí)行分子機(jī)器,蛋白質(zhì)掌控著早期疾病和疾病進(jìn)程的信號傳導(dǎo)。探求癌癥生物標(biāo)記物——細(xì)胞中的蛋白質(zhì)指紋有可能促使開發(fā)出一些測試方法,更早期地檢測疾病,早在癌癥形成之前鑒別出個體的特殊風(fēng)險,以及更好地指導(dǎo)患者的治療。然而沒有標(biāo)準(zhǔn)化和可重現(xiàn)的方法來檢測它們的水平,驗(yàn)證新發(fā)現(xiàn)的候選生物標(biāo)記物是一件不可能的事情。

每個有前景的生物標(biāo)記物都必須在試驗(yàn)中開展進(jìn)一步的研究,這就要求研究人員能夠檢測數(shù)百到數(shù)千個患者樣本中每個候選標(biāo)志物的豐度。由于將任何一種候選標(biāo)記物轉(zhuǎn)化至應(yīng)用的機(jī)率都極其的低,鑒別一種具有價值的生物標(biāo)記物必須對大量的蛋白質(zhì)進(jìn)行測試。

Paulovich說:“現(xiàn)在,你還不能對大多數(shù)的人類蛋白質(zhì)進(jìn)行大規(guī)模檢測。在我們完成人類基因組測序,獲得DNA分子全目錄10多年之后,仍然不能夠采用一種標(biāo)準(zhǔn)化定量方法在各種通量模式下對人類蛋白質(zhì)組開展研究。”

新方法研發(fā)及新舊方法比較

為了解決這一問題,Paulovich和同事們利用了一種稱作為多反應(yīng)檢測質(zhì)譜法(MRM-MS)的敏感性靶向蛋白質(zhì)檢測技術(shù)。這種質(zhì)譜法并非是全新的技術(shù),多年來的實(shí)驗(yàn)室利用它來測量藥物代謝產(chǎn)物和與先天性代謝缺陷有關(guān)的一些小分子。zui近,Paulovich和其他研究人員開始利用它來檢測人類蛋白質(zhì)。

采用研究人員開發(fā)的這種方法,每天每臺儀器能夠?qū)ui少20個樣本中的170種蛋白質(zhì)進(jìn)行高度特異性地、地、多路定量分析;任何其他的現(xiàn)有技術(shù)都沒有這種能力。

由于質(zhì)譜技術(shù)是針對性的,這意味著研究人員能夠調(diào)整設(shè)備尋找癌細(xì)胞或其他樣品類型中特殊的蛋白質(zhì)亞群,相比于非針對性策略,它可以在更低的水平上檢測微量血液樣本或活檢標(biāo)本中目的蛋白質(zhì)的存在。

研究的主要作者、Paulovich實(shí)驗(yàn)室分析化學(xué)家Jacob Kennedy說:“我們的目標(biāo)是用這一技術(shù)來取代當(dāng)前采用的一些非常老舊的技術(shù)。”

當(dāng)前,研究人員通常是采用Western blotting、ELISA或是免疫組化(IHC)技術(shù)來檢測樣本中的蛋白質(zhì)水平。這些方法往往無法在實(shí)驗(yàn)室之間重現(xiàn)結(jié)果,從而很難驗(yàn)證適用于的候選生物標(biāo)記物,它們不適用于一次檢測大量的蛋白質(zhì)和樣本。

Paulovich和同事們通過分析ruxian癌細(xì)胞生成的300多種已知蛋白質(zhì)驗(yàn)證了他們的技術(shù);研究結(jié)果表明,MRM-MS可以重現(xiàn)及擴(kuò)展以往采用其他技術(shù)進(jìn)行ruxian癌研究所生成的觀察結(jié)果。

該研究證實(shí)了,MRM-MS能夠以一種標(biāo)準(zhǔn)化方式一次檢測許多的蛋白質(zhì),為開展性的、有組織的研究工作定量人類蛋白質(zhì)中的每種蛋白奠定了基礎(chǔ)。

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